| 1. |
持有日本鐵路周遊券的普通車廂票者使用綠色車廂時，需支付綠色車廂費用，以及搭乘特急或急行的區間費用。 |
| 2. |
持有日本鐵路周遊券的普通車廂票或軟席車廂票者使用新幹線或特急列車的普通包廂時，需支付新幹線特急費用或特急費用。 |
| 3. |
持有日本鐵路周遊券的普通車廂票或軟席車廂票者使用特急列車的綠色包廂時，除了綠色包廂費用之外，另需支付特急費用。以少於包廂人數使用綠色或普通包廂時，除了上述費用之外，另需支付少於包廂人數部分的孩童車資、費用。此外，兩人以下無法使用山陽新幹線的普通包廂。
持普通車廂或綠色車廂的日本鐵路周遊券搭乘新幹線的GranClass車廂的旅客，需支付GranClass車廂費和搭乘區間的特急費用。 |
| 4. |
持有日本鐵路周遊券的普通車廂票或軟席車廂票者使用特急臥舖車或急行臥舖車時，除了臥舖費用之外，另需支付特急或急行費用。此外，搭乘臥舖車經過盛岡∼青森之間的旅客，需在車內支付盛岡∼目時之間的IGR岩手銀河鐵路線和目時∼青森之間的青森鐵路線的車資。 |
| 5. |
持普通車廂或者綠色車廂的日本鐵路周遊券的旅客，如搭乘需要乘車整理券或Liner券的列車，必須支付乘車整理費或Liner費。 |
| 6. |
若搭車過程中日期改變，跨越至有效期最終日的隔天，到出第一個剪票口時為止，車資不變；到下了有效期最終日搭乘的列車時為止，費用不變。 |
| 7. |
持有日本鐵路周遊券的軟席車廂票者使用普通車廂指定席或自由席，車費差價等也不予退還。 |
| 8. |
若指定席客滿，則必須使用自由席。這種情況下，車資差價等也不予退還。 |
| 9. |
使用日本鐵路周遊券不能利用東海道•山陽•九州新幹線的“Nozomi號”、“Mizuho號”，自由席、指定席均不可。利用“Nozomi號”、“Mizuho號”時，必須另外支付車費及特急費用，並且利用綠色車廂時必須另外支付綠色車廂費。 |
